Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhl40Q9D783 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms