Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13Q9D777 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms