Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc52a3Q9D6X5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc52a3Q9D6X5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms