Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tube1Q9D6T1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tube1Q9D6T1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tube1Q9D6T1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tube1Q9D6T1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tube1Q9D6T1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tube1Q9D6T1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tube1Q9D6T1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tube1Q9D6T1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tube1Q9D6T1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tube1Q9D6T1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tube1Q9D6T1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms