Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ca13Q9D6N1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ca13Q9D6N1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms