Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms