Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl8cQ9D6I0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl8cQ9D6I0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl8cQ9D6I0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl8cQ9D6I0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl8cQ9D6I0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl8cQ9D6I0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl8cQ9D6I0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl8cQ9D6I0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl8cQ9D6I0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl8cQ9D6I0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rtl8cQ9D6I0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rtl8cQ9D6I0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rtl8cQ9D6I0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rtl8cQ9D6I0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rtl8cQ9D6I0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rtl8cQ9D6I0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rtl8cQ9D6I0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rtl8cQ9D6I0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl8cQ9D6I0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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