Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra4Q9D6F4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra4Q9D6F4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms