Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr42e1Q9D665 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms