Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D5Q8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms