Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc130Q9D516 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc130Q9D516 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms