Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox2aQ9D4Y3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms