Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lonrf3Q9D4H7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms