Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933436I01RikQ9D3T1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933436I01RikQ9D3T1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms