Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tchhl1Q9D3P1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tchhl1Q9D3P1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms