Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z1

Ceacam20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam20Q9D2Z1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam20Q9D2Z1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms