Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snapc3Q9D2C9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms