Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Bcas2Q9D287 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Bcas2Q9D287 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Bcas2Q9D287 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Bcas2Q9D287 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Bcas2Q9D287 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Bcas2Q9D287 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Bcas2Q9D287 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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