Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syf2Q9D198 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms