Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exosc7Q9D0M0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms