Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e1Q9D0D5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms