Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp11Q9CZJ1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms