Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms