Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms