Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Yif1bQ9CX30 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms