Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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