Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ist1Q9CX00 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ist1Q9CX00 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms