Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pin4Q9CWW6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pin4Q9CWW6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms