Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc3Q9CWU5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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