Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms