Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx10Q9CWT3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx10Q9CWT3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms