Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnot11Q9CWN7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cnot11Q9CWN7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cnot11Q9CWN7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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