Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF6

Bbs2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs2Q9CWF6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Bbs2Q9CWF6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Bbs2Q9CWF6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Bbs2Q9CWF6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bbs2Q9CWF6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms