Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms