Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930553M12RikQ9CUH1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms