Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Fcf1Q9CTH6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Fcf1Q9CTH6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Fcf1Q9CTH6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Fcf1Q9CTH6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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