Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CR55 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CR55 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CR55 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CR55 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CR55 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CR55 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms