Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska2Q9CR46 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms