Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR25

Dph2, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph2Q9CR25 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dph2Q9CR25 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms