Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms