Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc2Q9CQP2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc2Q9CQP2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms