Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdm1Q9CQK3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdm1Q9CQK3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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