Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms