Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpb2Q9CQI7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms