Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RTRAFQ9CQE8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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