Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ergic3Q9CQE7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms