Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms