Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc18Q9CQ07 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms