Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CPS8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CPS8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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