Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce3Q9CPR8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms